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1986年，全民所有制企业改革启动，12月5日，国务院作出《关于深化企业改革增强企业活力的若干规定》。1987年4月，宗庆后同志承包了上城区校办企业经销部。

1988年9月5日邓小平同志提出“科学技术是第一生产力”的著名论断。同年娃哈哈成功开发出儿童营养液，该产品于1992年获得国家星火科技二等奖。

1992年社会主义市场经济体制改革目标确立。1991年，宗庆后同志在杭州市政府的牵线搭桥下，以8000余万元的代价有偿兼并了国营老厂——杭州罐头食品厂，创造了“小鱼吃大鱼”的奇迹。

1994年国务院提出对口支援三峡库区移民工作的号召，同年，娃哈哈创造性地以“移民任务与移民经费总承包”的改革思路，兼并了涪陵地区受淹的3家特困企业，组建娃哈哈涪陵有限责任公司。

娃哈哈积极响应抗震救灾工作，勇于承担企业社会责任，维护社会和谐。倾尽全力扶持教育，贯彻扶贫先扶智的精准扶贫理念。

娃哈哈智能工厂，入选首批工信部智能制造试点项目。实现了生产线的生产全过程自动化与智能化，为两化融合提供了娃哈哈样本。

娃哈哈智能菌种生产车间。娃哈哈自主研发了具有完全自主知识产权的益生菌菌种，利用现代生物工程技术，推动饮料从“安全”向“健康”转变。

2017年11月17日，娃哈哈三十周年庆典在浙大紫荆港校区举办。